Минобороны Украины согласилось ее рассматривать в числе других спустя неделю после трагедии
4 октября. Министерство обороны опровергает версию зарубежных СМИ о том, что самолет ТУ-154 мог быть сбит украинской ракетой в ходе учений ВВС и ПВО Украины. По словам министра обороны, переданным пресс-секретарем Константином Хивренко, «ни направление стрельбы, ни расстояние ни теоретически, ни практически не совпадают с точкой взрыва самолета», а «все ракеты, которые были применены во время учений, зафиксированы соответствующими приборами и достигли заданной цели».
5 октября. Глава Минобороны Александр Кузьмук заявляет, что «все точки контроля», проводившегося за пусками ракет во время учений в восточном Крыму возле мыса Опук, показали, что все падения и все цели находились в ближней зоне стрельбы… на расстоянии от 20 до 40 км и вне направления гибели Ту-154».
6 — 8 октября. Главнокомандующий войсками ПВО Владимир Ткачев, демонстрируя журналистам диаграммы и снимки, заявляет, что 4 октября в 12. 44, когда с экранов радаров исчез российский самолет, ракета С-200, которая якобы могла стать причиной катастрофы, уже находилась в воде в 75--85 км от места запуска.
9 октября. Минобороны по-прежнему настаивает на том, что ракета, выпущенная во время учений из ракетно-зенитного комплекса С-200, не могла сбить российский лайнер. Александр Кузьмук заявляет в Верховной Раде, что ракета по всем расчетам самоликвидировалась и упала в море в пределах полигона за две минуты до момента исчезновения российского самолета с экранов радаров. К тому же расстояние от места гибели Ту-154 до пусковой установки С-200 составляло около 270 км, что, как уверял министр, превышает максимальную дальность полета ракеты этого комплекса.
10 октября. Минобороны продолжает настаивать на своей непричастности к авиакатастрофе. Представители военного ведомства опровергают прозвучавшую в российских СМИ информацию, будто на месте падения Ту-154 были обнаружены фрагменты ракеты С-200.
11 октября. Госкомиссия России по расследованию причин авиакатастрофы склоняется к «ракетной» версии гибели Ту-154. Члены комиссии высказывают мнение, что ракета С-200 взорвалась в нескольких десятках метров от самолета. От Министерства обороны Украины официальных заявлений не последовало.
12 октября. Руководство Минобороны признает, что причиной гибели авиалайнера могло стать «неумышленное поражение» ракетой С-200.
13 октября. Александр Кузьмук признал причастность украинских ПВО к трагедии и заявил, что возглавляемое им ведомство не пыталось ввести общество в заблуждение… Главнокомандующий войсками Противовоздушной обороны Украины Владимир Ткачев назвал гибель Ту-154 от ракеты С-200 трагической случайностью и подал в отставку.
Р. S. Факт попадания ракеты в жилой дом в Броварах 20 апреля 2000 года военные признали через два дня после того, как в руинах офицер МЧС обнаружил фрагмент ракеты с регистрационным номером.